Elektroforéza v polyakrylamidových géloch (PAGE). (Elektormigračné metódy v biochémií)
22.06.2012 16:28
Elektroforéza v polyakrylamidových géloch (PAGE).
- delenie podľa veľkosti náboja a podľa veľkosti molekúl
- možnosť rozdeliť látky s rovnakým nábojom, ale rôznou veľkosťou molekúl
Výhody:
ľahká príprava gélu
jednoznačné, presne definované zloženie gélu
definovaná veľkosť pórov
výborné mechanické vlastnosti gélu
priesvitnosť = umožňuje denzitometrické vyhodnotenie
nízka adsorpcia látok
gél je chemicky inertný
najväčšia rozlišovacia kapacita
Nevýhoda:
toxicita monomérov pre prípravy gélu
Polyakrylamid sa pripravuje polymerizáciou akrylamidu (H2C=CH-CONH2)
a N,N´-metylénbisakrylamidu (H2C=CH-CO-NH-CH2-NH-CO-CH=CH2).
Polymerizácia sa iniciuje svetlom alebo chemicky napr. persíranom amónnym
a tetrametyléndiamínom (TEMED).
Veľkosť pórov gélu je nepriamoúmerná koncentrácii akrylamidu:
% akrylamidu Mr delených látok
15 -30 menej ako 10 000
12 10 000 - 90 000
7,5 30 000 - 150 000
4 90 000 - 1 000 000
Postup:
- gél sa pripravuje vo forme valčekov v sklených trubičkách o priemere 5 - 6 mm a
dĺžke 6 - 8 cm alebo vo forme platní o hrúbke 0,5 -2,5 mm.
- pre aplikáciu vzorky sa na začiatku polyakrylamidového gélu pripraví tzv.
štartovací gél (s prídavkom agarózy), do ktorého sa pri platňovom usporiadaní
vkladá "hrebeň" (vytvoria sa tak miesta pre nanášanie vzoriek)
Detekcia:
denzitometricky (bielkoviny 280 nm, nukl. kyseliny 260 nm)
fixácia (kys. trichlóroctová) a farbenie (bielkoviny Amidočerň 10B, Coomassie Briliant
Blue R 250, nukl. kyseliny sa farbia striebrom)
Konvenčná PAGE: homogénny gél, delenie látok podľa veľkosti náboja a veľkosti
molekúl
PAGE , pri ktorej sa látky delia len podľa veľkosti molekúl je
PAGE v gradientovom géli: napr. s plynule sa zmenšujúcou veľkosťou pórov
- v určitom mieste sa gél stáva neprechodný pre určitú veľkosť molekúl
PAGE v prostredí dodecyl síranu sodného = SDS-PAGE:
bielkoviny sa pred elfo denaturujú v SDS s prídavkom tiolového činidla (napr. 2-
merkaptoetanol). Rozštiepia sa disulfidické väzby a SDS sa viaže v množstve
1,4g na gram bielkoviny. Bielkovina získa záporný náboj a tak sa pôvodné
náboje neprejavia. Bielkoviny sa delia na základe rozdielnych veľkostí molekúl.
Ideálna metóda na stanovenie molekulovej hmotnosti bielkovín.